MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 2

Total Repeats: 29572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012857	CG	4	8	263	270	0 %	0 %	50 %	50 %	241665038
2	NC_012857	CCG	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665038
3	NC_012857	GCC	2	6	372	377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665038
4	NC_012857	GCCC	2	8	408	415	0 %	0 %	25 %	75 %	241665038
5	NC_012857	CGG	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665038
6	NC_012857	CGG	2	6	465	470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665038
7	NC_012857	CGC	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665038
8	NC_012857	GACC	2	8	525	532	25 %	0 %	25 %	50 %	241665038
9	NC_012857	CTT	2	6	534	539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665038
10	NC_012857	CTG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665038
11	NC_012857	GCA	2	6	573	578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665038
12	NC_012857	GCC	2	6	581	586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665038
13	NC_012857	CTG	2	6	592	597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665038
14	NC_012857	CG	3	6	647	652	0 %	0 %	50 %	50 %	241665038
15	NC_012857	ACGC	2	8	686	693	25 %	0 %	25 %	50 %	241665038
16	NC_012857	GC	3	6	716	721	0 %	0 %	50 %	50 %	241665038
17	NC_012857	CG	3	6	773	778	0 %	0 %	50 %	50 %	241665038
18	NC_012857	TCG	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665038
19	NC_012857	CGC	2	6	878	883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665038
20	NC_012857	TGC	2	6	995	1000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665038
21	NC_012857	CGC	2	6	1052	1057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665038
22	NC_012857	GCTG	2	8	1058	1065	0 %	25 %	50 %	25 %	241665038
23	NC_012857	GCC	2	6	1066	1071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665038
24	NC_012857	CCGC	2	8	1083	1090	0 %	0 %	25 %	75 %	241665038
25	NC_012857	ACG	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665038
26	NC_012857	CGG	2	6	1173	1178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665038
27	NC_012857	ACC	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665038
28	NC_012857	GAA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665038
29	NC_012857	CAT	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665039
30	NC_012857	ACC	2	6	1723	1728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665039
31	NC_012857	TCT	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665039
32	NC_012857	CCA	2	6	1808	1813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665039
33	NC_012857	CTG	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665039
34	NC_012857	AAG	2	6	1981	1986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665039
35	NC_012857	CG	5	10	2043	2052	0 %	0 %	50 %	50 %	241665039
36	NC_012857	CCA	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665039
37	NC_012857	GCT	2	6	2175	2180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665039
38	NC_012857	CTGG	2	8	2187	2194	0 %	25 %	50 %	25 %	241665039
39	NC_012857	GTG	3	9	2230	2238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665039
40	NC_012857	GC	3	6	2363	2368	0 %	0 %	50 %	50 %	241665039
41	NC_012857	CGT	2	6	2415	2420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665039
42	NC_012857	CTC	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241665039
43	NC_012857	GC	4	8	2438	2445	0 %	0 %	50 %	50 %	241665039
44	NC_012857	CGG	2	6	2652	2657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665039
45	NC_012857	CAC	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665039
46	NC_012857	CG	3	6	2689	2694	0 %	0 %	50 %	50 %	241665039
47	NC_012857	CACAC	2	10	2723	2732	40 %	0 %	0 %	60 %	241665039
48	NC_012857	ACG	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665039
49	NC_012857	CTG	2	6	2815	2820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665039
50	NC_012857	AGC	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665039
51	NC_012857	CAC	2	6	2865	2870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665039
52	NC_012857	GC	3	6	2871	2876	0 %	0 %	50 %	50 %	241665039
53	NC_012857	GGA	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241665039
54	NC_012857	CGA	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665039
55	NC_012857	TCA	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665039
56	NC_012857	GCG	2	6	2957	2962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665039
57	NC_012857	CG	3	6	2975	2980	0 %	0 %	50 %	50 %	241665039
58	NC_012857	GAGCTT	2	12	3145	3156	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241665040
59	NC_012857	GATCTC	2	12	3172	3183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241665040
60	NC_012857	ATC	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665040
61	NC_012857	TCG	2	6	3209	3214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665040
62	NC_012857	CGG	2	6	3222	3227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665040
63	NC_012857	CGTG	2	8	3267	3274	0 %	25 %	50 %	25 %	241665040
64	NC_012857	GGCG	2	8	3282	3289	0 %	0 %	75 %	25 %	241665040
65	NC_012857	TGCT	2	8	3389	3396	0 %	50 %	25 %	25 %	241665040
66	NC_012857	CG	3	6	3430	3435	0 %	0 %	50 %	50 %	241665040
67	NC_012857	GCA	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665040
68	NC_012857	CTT	2	6	3525	3530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665040
69	NC_012857	GCA	3	9	3534	3542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665040
70	NC_012857	CGTG	2	8	3579	3586	0 %	25 %	50 %	25 %	241665040
71	NC_012857	CGAG	2	8	3588	3595	25 %	0 %	50 %	25 %	241665040
72	NC_012857	AGG	2	6	3620	3625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241665040
73	NC_012857	GTGG	2	8	3652	3659	0 %	25 %	75 %	0 %	241665040
74	NC_012857	GCG	2	6	3798	3803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665041
75	NC_012857	GTC	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665041
76	NC_012857	GGT	2	6	3918	3923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665041
77	NC_012857	GC	3	6	3943	3948	0 %	0 %	50 %	50 %	241665041
78	NC_012857	TCG	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665041
79	NC_012857	GAAC	2	8	4008	4015	50 %	0 %	25 %	25 %	241665041
80	NC_012857	CGGC	2	8	4076	4083	0 %	0 %	50 %	50 %	241665041
81	NC_012857	GTG	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665041
82	NC_012857	GCC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665041
83	NC_012857	TGG	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665041
84	NC_012857	GC	3	6	4299	4304	0 %	0 %	50 %	50 %	241665041
85	NC_012857	GC	3	6	4327	4332	0 %	0 %	50 %	50 %	241665041
86	NC_012857	GCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665041
87	NC_012857	CCT	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241665041
88	NC_012857	TGT	2	6	4488	4493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241665041
89	NC_012857	CCGC	2	8	4509	4516	0 %	0 %	25 %	75 %	241665041
90	NC_012857	CGG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665041
91	NC_012857	CAG	3	9	4609	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665041
92	NC_012857	GC	5	10	4635	4644	0 %	0 %	50 %	50 %	241665041
93	NC_012857	C	7	7	4666	4672	0 %	0 %	0 %	100 %	241665041
94	NC_012857	CG	3	6	4680	4685	0 %	0 %	50 %	50 %	241665041
95	NC_012857	GGC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665041
96	NC_012857	CG	3	6	4735	4740	0 %	0 %	50 %	50 %	241665041
97	NC_012857	GC	3	6	4744	4749	0 %	0 %	50 %	50 %	241665041
98	NC_012857	TCG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665041
99	NC_012857	GAC	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665041
100	NC_012857	GCAC	2	8	4887	4894	25 %	0 %	25 %	50 %	241665041
101	NC_012857	GCA	2	6	4919	4924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665041
102	NC_012857	GCA	2	6	4929	4934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665041
103	NC_012857	CAG	2	6	4963	4968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665041
104	NC_012857	CGT	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665041
105	NC_012857	GATC	2	8	4998	5005	25 %	25 %	25 %	25 %	241665041
106	NC_012857	GCC	2	6	5150	5155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665042
107	NC_012857	CAG	2	6	5157	5162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665042
108	NC_012857	TGG	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665042
109	NC_012857	GCA	2	6	5230	5235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665042
110	NC_012857	CTG	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665042
111	NC_012857	CGA	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665042
112	NC_012857	CAC	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665042
113	NC_012857	TGA	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665042
114	NC_012857	GTA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665042
115	NC_012857	GCA	2	6	5378	5383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665042
116	NC_012857	CCA	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665042
117	NC_012857	CGC	3	9	5454	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665042
118	NC_012857	ACC	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665042
119	NC_012857	CAG	2	6	5577	5582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665042
120	NC_012857	CGC	2	6	5595	5600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665042
121	NC_012857	GCA	2	6	5711	5716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665042
122	NC_012857	CGC	2	6	5726	5731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665042
123	NC_012857	GC	3	6	5733	5738	0 %	0 %	50 %	50 %	241665042
124	NC_012857	CGC	2	6	5805	5810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665042
125	NC_012857	CGG	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665042
126	NC_012857	CGC	2	6	5851	5856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665042
127	NC_012857	CATCG	2	10	5872	5881	20 %	20 %	20 %	40 %	241665042
128	NC_012857	CAT	2	6	5943	5948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665042
129	NC_012857	AGC	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665042
130	NC_012857	CTC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241665042
131	NC_012857	CCA	2	6	6047	6052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665042
132	NC_012857	GAA	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665042
133	NC_012857	CCG	2	6	6232	6237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665042
134	NC_012857	CAT	3	9	6246	6254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665042
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249	NC_012857	GCTG	2	8	11242	11249	0 %	25 %	50 %	25 %	241665046
250	NC_012857	GC	3	6	11256	11261	0 %	0 %	50 %	50 %	241665046
251	NC_012857	GC	4	8	11291	11298	0 %	0 %	50 %	50 %	241665046
252	NC_012857	GCCG	2	8	11309	11316	0 %	0 %	50 %	50 %	241665046
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256	NC_012857	CCCG	2	8	11451	11458	0 %	0 %	25 %	75 %	241665046
257	NC_012857	GCA	2	6	11468	11473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665046
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259	NC_012857	ACC	3	9	11502	11510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665046
260	NC_012857	CCG	2	6	11540	11545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665046
261	NC_012857	GC	4	8	11547	11554	0 %	0 %	50 %	50 %	241665046
262	NC_012857	GCG	2	6	11566	11571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665046
263	NC_012857	CGT	2	6	11621	11626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665046
264	NC_012857	CGC	2	6	11628	11633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665046
265	NC_012857	GCT	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665046
266	NC_012857	TGC	2	6	11893	11898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665046
267	NC_012857	TCGT	2	8	11904	11911	0 %	50 %	25 %	25 %	241665046
268	NC_012857	CGA	2	6	11915	11920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665046
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270	NC_012857	CGA	2	6	11966	11971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665046
271	NC_012857	CGC	2	6	11999	12004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665046
272	NC_012857	GC	3	6	12047	12052	0 %	0 %	50 %	50 %	241665046
273	NC_012857	GGC	2	6	12080	12085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665046
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277	NC_012857	GGC	2	6	12350	12355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665046
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279	NC_012857	GCTGC	2	10	12432	12441	0 %	20 %	40 %	40 %	241665046
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289	NC_012857	CAG	2	6	12806	12811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665047
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292	NC_012857	GTC	2	6	12906	12911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665047
293	NC_012857	GC	3	6	12923	12928	0 %	0 %	50 %	50 %	241665047
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382	NC_012857	ACG	2	6	16355	16360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665048
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388	NC_012857	GC	4	8	16497	16504	0 %	0 %	50 %	50 %	241665048
389	NC_012857	GCCG	2	8	16513	16520	0 %	0 %	50 %	50 %	241665048
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391	NC_012857	CCT	2	6	16692	16697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241665048
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500	NC_012857	GGCT	2	8	20624	20631	0 %	25 %	50 %	25 %	241665052

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